MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter coli 15-537360 plasmid pCC42yr

Total Repeats: 555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022656	TTC	2	6	228	233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561978
2	NC_022656	ATA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561978
3	NC_022656	AGCAA	2	10	302	311	60 %	0 %	20 %	20 %	556561978
4	NC_022656	AT	3	6	319	324	50 %	50 %	0 %	0 %	556561978
5	NC_022656	TAA	2	6	344	349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561978
6	NC_022656	A	6	6	384	389	100 %	0 %	0 %	0 %	556561978
7	NC_022656	AATC	2	8	408	415	50 %	25 %	0 %	25 %	556561978
8	NC_022656	A	7	7	467	473	100 %	0 %	0 %	0 %	556561978
9	NC_022656	TAT	2	6	517	522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561978
10	NC_022656	GTG	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561979
11	NC_022656	ATT	2	6	1109	1114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561979
12	NC_022656	A	6	6	1120	1125	100 %	0 %	0 %	0 %	556561979
13	NC_022656	AAAT	2	8	1136	1143	75 %	25 %	0 %	0 %	556561979
14	NC_022656	A	6	6	1148	1153	100 %	0 %	0 %	0 %	556561979
15	NC_022656	T	7	7	1158	1164	0 %	100 %	0 %	0 %	556561979
16	NC_022656	T	6	6	1181	1186	0 %	100 %	0 %	0 %	556561979
17	NC_022656	A	6	6	1190	1195	100 %	0 %	0 %	0 %	556561979
18	NC_022656	ATA	2	6	1200	1205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561979
19	NC_022656	GAAA	2	8	1237	1244	75 %	0 %	25 %	0 %	556561980
20	NC_022656	TAG	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561980
21	NC_022656	TA	3	6	1278	1283	50 %	50 %	0 %	0 %	556561980
22	NC_022656	ATA	2	6	1305	1310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561980
23	NC_022656	TAC	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561980
24	NC_022656	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	556561980
25	NC_022656	GAT	2	6	1367	1372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561980
26	NC_022656	TTA	2	6	1374	1379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561980
27	NC_022656	ATTA	2	8	1397	1404	50 %	50 %	0 %	0 %	556561980
28	NC_022656	AGT	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561980
29	NC_022656	ATG	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561980
30	NC_022656	A	7	7	1520	1526	100 %	0 %	0 %	0 %	556561980
31	NC_022656	AAC	2	6	1602	1607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561980
32	NC_022656	AAG	2	6	1608	1613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561980
33	NC_022656	AT	3	6	1639	1644	50 %	50 %	0 %	0 %	556561980
34	NC_022656	ACAA	2	8	1699	1706	75 %	0 %	0 %	25 %	556561980
35	NC_022656	AGTAGA	2	12	1750	1761	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	556561980
36	NC_022656	ATT	2	6	1806	1811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561980
37	NC_022656	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561980
38	NC_022656	A	6	6	1874	1879	100 %	0 %	0 %	0 %	556561980
39	NC_022656	CTT	2	6	1926	1931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561980
40	NC_022656	AAG	2	6	1956	1961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561980
41	NC_022656	TGG	2	6	1984	1989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561980
42	NC_022656	AAG	2	6	2064	2069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561980
43	NC_022656	T	7	7	2087	2093	0 %	100 %	0 %	0 %	556561981
44	NC_022656	GAA	2	6	2122	2127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561981
45	NC_022656	CAA	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561981
46	NC_022656	ATTT	2	8	2161	2168	25 %	75 %	0 %	0 %	556561981
47	NC_022656	T	6	6	2166	2171	0 %	100 %	0 %	0 %	556561981
48	NC_022656	T	6	6	2195	2200	0 %	100 %	0 %	0 %	556561981
49	NC_022656	A	6	6	2236	2241	100 %	0 %	0 %	0 %	556561981
50	NC_022656	ATT	2	6	2342	2347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561981
51	NC_022656	TGT	2	6	2410	2415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561981
52	NC_022656	A	6	6	2434	2439	100 %	0 %	0 %	0 %	556561981
53	NC_022656	A	7	7	2574	2580	100 %	0 %	0 %	0 %	556561982
54	NC_022656	A	6	6	2626	2631	100 %	0 %	0 %	0 %	556561982
55	NC_022656	A	8	8	2656	2663	100 %	0 %	0 %	0 %	556561982
56	NC_022656	CAAG	2	8	3007	3014	50 %	0 %	25 %	25 %	556561983
57	NC_022656	A	6	6	3023	3028	100 %	0 %	0 %	0 %	556561983
58	NC_022656	ATTTT	2	10	3049	3058	20 %	80 %	0 %	0 %	556561983
59	NC_022656	GATAT	2	10	3133	3142	40 %	40 %	20 %	0 %	556561983
60	NC_022656	CTT	2	6	3199	3204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561983
61	NC_022656	A	7	7	3318	3324	100 %	0 %	0 %	0 %	556561983
62	NC_022656	TGA	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561983
63	NC_022656	CAAAA	2	10	3377	3386	80 %	0 %	0 %	20 %	556561983
64	NC_022656	GTT	2	6	3430	3435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561983
65	NC_022656	ATT	2	6	3475	3480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561983
66	NC_022656	AAG	2	6	3665	3670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561983
67	NC_022656	GGA	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561983
68	NC_022656	GGA	2	6	3745	3750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561983
69	NC_022656	CAA	2	6	3782	3787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561983
70	NC_022656	AATT	2	8	3803	3810	50 %	50 %	0 %	0 %	556561983
71	NC_022656	AGG	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561983
72	NC_022656	A	6	6	3940	3945	100 %	0 %	0 %	0 %	556561984
73	NC_022656	ATTTT	2	10	3952	3961	20 %	80 %	0 %	0 %	556561984
74	NC_022656	CAA	2	6	3992	3997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561984
75	NC_022656	TAT	2	6	4068	4073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561984
76	NC_022656	TGGAGC	2	12	4092	4103	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	556561984
77	NC_022656	TTA	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561984
78	NC_022656	TAG	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561984
79	NC_022656	T	6	6	4205	4210	0 %	100 %	0 %	0 %	556561984
80	NC_022656	CAA	2	6	4211	4216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561984
81	NC_022656	GAA	2	6	4236	4241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561985
82	NC_022656	CAA	2	6	4271	4276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561985
83	NC_022656	T	8	8	4392	4399	0 %	100 %	0 %	0 %	556561985
84	NC_022656	A	6	6	4476	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	556561985
85	NC_022656	TAT	2	6	4485	4490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561985
86	NC_022656	AAGCA	2	10	4547	4556	60 %	0 %	20 %	20 %	556561986
87	NC_022656	CAA	2	6	4613	4618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561986
88	NC_022656	TAT	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
89	NC_022656	GAAA	2	8	4683	4690	75 %	0 %	25 %	0 %	556561986
90	NC_022656	ATTG	2	8	4752	4759	25 %	50 %	25 %	0 %	556561986
91	NC_022656	GAAA	2	8	4836	4843	75 %	0 %	25 %	0 %	556561986
92	NC_022656	ATT	2	6	4846	4851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
93	NC_022656	ATAA	2	8	4920	4927	75 %	25 %	0 %	0 %	556561986
94	NC_022656	TGA	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
95	NC_022656	A	6	6	4958	4963	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
96	NC_022656	AGA	2	6	5018	5023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561986
97	NC_022656	TA	3	6	5037	5042	50 %	50 %	0 %	0 %	556561986
98	NC_022656	ATA	2	6	5083	5088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561986
99	NC_022656	GAT	2	6	5103	5108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
100	NC_022656	AT	3	6	5117	5122	50 %	50 %	0 %	0 %	556561986
101	NC_022656	GA	3	6	5142	5147	50 %	0 %	50 %	0 %	556561986
102	NC_022656	A	6	6	5149	5154	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
103	NC_022656	TAC	2	6	5158	5163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561986
104	NC_022656	AT	3	6	5243	5248	50 %	50 %	0 %	0 %	556561986
105	NC_022656	ATT	2	6	5253	5258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
106	NC_022656	GAC	2	6	5358	5363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561986
107	NC_022656	TAA	2	6	5384	5389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561986
108	NC_022656	A	6	6	5397	5402	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
109	NC_022656	CAA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561986
110	NC_022656	A	6	6	5410	5415	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
111	NC_022656	GAT	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
112	NC_022656	TAT	2	6	5541	5546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
113	NC_022656	CAAT	2	8	5653	5660	50 %	25 %	0 %	25 %	556561986
114	NC_022656	ACTTA	2	10	5732	5741	40 %	40 %	0 %	20 %	556561986
115	NC_022656	TCC	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561986
116	NC_022656	AC	3	6	5888	5893	50 %	0 %	0 %	50 %	556561986
117	NC_022656	TCC	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561986
118	NC_022656	CTTG	2	8	5949	5956	0 %	50 %	25 %	25 %	556561986
119	NC_022656	ATG	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
120	NC_022656	TCAT	2	8	6059	6066	25 %	50 %	0 %	25 %	556561986
121	NC_022656	CAAAA	2	10	6172	6181	80 %	0 %	0 %	20 %	556561986
122	NC_022656	A	8	8	6178	6185	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
123	NC_022656	ATT	2	6	6286	6291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
124	NC_022656	GGT	2	6	6309	6314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561986
125	NC_022656	T	6	6	6314	6319	0 %	100 %	0 %	0 %	556561986
126	NC_022656	TTAAGC	2	12	6342	6353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556561986
127	NC_022656	AGA	2	6	6374	6379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561986
128	NC_022656	TGA	2	6	6382	6387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
129	NC_022656	TCA	2	6	6472	6477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561986
130	NC_022656	TGA	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561986
131	NC_022656	CTA	2	6	6640	6645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561986
132	NC_022656	A	6	6	6675	6680	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
133	NC_022656	AAT	2	6	6756	6761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561986
134	NC_022656	A	6	6	6769	6774	100 %	0 %	0 %	0 %	556561986
135	NC_022656	ATT	2	6	6781	6786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561986
136	NC_022656	CAA	2	6	6850	6855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561986
137	NC_022656	AAGT	2	8	6865	6872	50 %	25 %	25 %	0 %	556561986
138	NC_022656	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561986
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402	NC_022656	T	7	7	19223	19229	0 %	100 %	0 %	0 %	556562000
403	NC_022656	TGA	2	6	19265	19270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556562000
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